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舞台・故事
密阿雷市
在推动都市再开发的「密阿雷市」展开的全新故事
冒险的舞台是以人与宝可梦共存的城市为目标，推动都市再开发的「密阿雷市」。
与在2013年发售的《宝可梦 X》《宝可梦 Y》中登场的「密阿雷市」相比，城市里的花草树木更多，还能见到充满最新科技气息的设备。
野生特区
野生宝可梦们栖息的「野生特区」
在大企业阔星公司推动都市再开发的密阿雷市里，存在着为了实现和宝可梦共存而打造的「野生特区」。野生宝可梦们栖息在这个由最新技术整备的区域中，在这里可以与它们对战或是投掷精灵球捕捉它们。
ZA登峰战
伴随着日落，每晚举行的「ZA登峰战」！
在密阿雷市，一到夜晚城市里就会出现以最新技术红色全像投影所环绕住的「对战特区」。特区内每天都会举办「ZA登峰战」，从日落到黎明都有训练家们在这里以宝可梦对战一较高下。
全新战斗
《宝可梦传说 Z-A》的战斗不同于以往《宝可梦》系列里1回合行动1次的模式，宝可梦会和训练家一起移动，并同时根据训练家的指示使出招式。
除了属性相克之外，增添了替换宝可梦和选择招式的时机、招式的可达范围以及出招速度等新的游戏要素，可以享受前所未有的宝可梦对战也是本作的一大乐趣。
在密阿雷市，不时能见到超越进化的进化――「超级进化」。如何纯熟运用「超级进化」，很可能成为掌握胜负的关键。
能够大幅影响对战胜败的「超级进化」是什么？
「超级进化」是超越了进化的极限后更高境界的进化，仅有部分宝可梦能超级进化。
透过暂时释放宝可梦潜藏的力量，达到比一般进化更上一层的力量提升。 「超级进化」后的宝可梦外观会改变，在那之中甚至还有属性会改变的宝可梦。
当训练家与宝可梦之间有强烈的牵绊时，训练家配戴在身上的「钥石」与宝可梦携带的「超级石」产生共鸣，就能进行「超级进化」。
主角身上配戴着崁入了「钥石」的「超级环」。似乎也有训练家会以不同的形式将「钥石」配戴在身上。
